Gjesværstappan ble i 1983 et naturreservat.  Miljømyndighetene ønsker å beskytte viktige sjøfuglekolonier, planter og dyreliv.  Landområdet er 1,7 kvadratkilometer i utstrekning.  Verneområdet omfatter også et havområdet på 5,5 kvadratkilometer rundt Gjesværstappan.  Mellom 15. juni og 15. august er det ikke lov å sette fot på den største øya: Storstappen, som rager 283 meter over havet på sitt høyeste punkt.

Miljømyndighetene er veldig interessert i å beskytte den største kolonien av lundefugl i Finnmark.  Den første observasjonen av Havhest ble gjort i 1978 og antallet Havhest er økende.  På 1980-tallet etablerte Havsula seg ved Gjesværstappan.  Andre fugler du kan observere ved Gjesværstappan er krykkje, skarv, lomvi, alke og havørn. 

.